2016年6月，质检总局同意支持上海检验检疫局将国境口岸卫生许可证核发、进出口商品检验鉴定机构许可纳入“证照分离”改革试点。改革实施一年多来，一系列“证照分离”改革措施的落实施行，有效地提升了许可办理的透明度和可预期值，打造了信息互联共享、证照监管协同、诚信自律结合、行业社会共治、风险预警及时的综合监管体系，企业对改革获得感良好，监管成效明显。
一是透明审批反响好。对国境口岸卫生许可证办理中审批条件、审批标准、审批程序等28处条款进行量化、细化，取消“其它”类兜底条款。发放许可办理办事指南、业务手册、监管手段的标准化资料1.4万册，印制国境卫生口岸许可证核发办事指南精简版，“一张图”告知企业办事人员怎么办理审批，“一张表”告知需要哪些材料，就能办妥审批，避免了企业反复提交补正材料而延误企业正常经营，得到企业高度肯定。2016年10月起，将改革措施从浦东机场覆盖到虹桥机场，让企业在上海两座机场办理许可得到同样的待遇。改革施行至今，浦东、虹桥两场国境口岸范围内共受理卫生许可申请487起，对申请材料不齐全的均采取一次性全部告知，实际办理时限在10-12天，较法定办理时限缩短41.75%，办证环境更加公开透明，改革措施知晓度普遍提升。2017年，选取企业群众迫切需要的许可证换发等5项行政审批相关事项推行当场办结新措施，作为“证照分离”改革的配套服务措施，将原有10-20天办理的换证等流程，直接压缩到当场办结。针对新申请企业不熟悉审批条件和监管要求的情况，为企业开展选址定点和设备设施等方面许可现场评审提前服务。2017年以来，对15家企业现场评审提前服务17次，有效减少了因选址不当、技术路径不正确等原因造成不予许可的情况。
二是公平营商实力强。对进出口商品检验鉴定机构审批条件、审批标准、审批程序等18处予以进一步明确，包括放开中资主体准入管制，删除了注册资本登记条件，明确检测条件和技术资源的审查要求、质量管理体系的判定标准；放宽外商投资机构申请条件，等同于中资机构申请条件。新政实施一年多来，上海地区进出口商品检验鉴定机构已达101家，具有独立法人资格的检验鉴定机构数量、检验鉴定业务量均居全国首位。2016年以来新设立的机构为12家，其中自贸区内新设立机构3家。2016年，上海地区检验鉴定机构营业收入98.60亿元，近全国三分之一，同比增长9.4%，从业人员逾2万人，累计检验鉴定逾331万批次，市场占有率位居全国第一。
三是综合监管显成效。制定《进出口商品检验鉴定机构监督管理细则》等7个监管文件，打造了由行政监管、行业自律、社会监督“三位一体”的监管体系。建立检验鉴定机构经营异常名录制度和严重违法机构“黑名单”制度，先后发布通报16份，涉及从业人员31名，充分发挥行业协会和社会监督作用。加强对检验鉴定机构检测能力监管，在进出口纺织品、日用陶瓷以及电子电器等与消费者紧密相关的产品领域，开展检验鉴定机构检测结果准确性抽查工作，2016年下半年共对上海地区22家检验鉴定机构累计抽查67次，初测不合格数8次，初测通过率在88.1%，监督检验鉴定机构落实问题整改。制定《口岸卫生监督分类分级管理操作规程》等11个监管文件，并结合国境口岸卫生监督综合信息管理系统，对口岸许可单位实行诚信管理、分类管理、动态管理等监管模式，将一企一册、诚信管理、分类管理、风险管理等监管措施数字化。2016年6月以来，上海国境口岸卫生监督发现2242项食品与卫生问题，签发卫生监督整改通知书90份，对企业法人代表约谈55次，开展国境口岸卫生监督违法行为行政处罚25件，其中警告6件、罚款19件，有效维护了上海航运枢纽的整体形象，在放宽准入的同时，守住安全底线，凸显“证照分离”改革事中事后监管成效。
2017年，质检部门已将国境口岸卫生许可证核发“证照分离”改革措施，复制推广到上海所有国境口岸。未来，将在下更大范围推进“证照分离”改革试点，针对企业准入的许可事项，以制度创新为先导，探索以告知承诺替代传统审批；以优化准入为手段，推行一体化办理、标准化审批、智能化服务；以提升服务质量为目标，拓展承诺办结、多证联办、当场办结、提前服务等便捷服务举措；以保安全、守底线、完善事中事后监管为重点，运行诚信管理、分类监管、风险监管、联合惩戒和社会监督相结合的综合监管体系，当好改革创新和服务把关的排头兵，让国务院、总局的改革要求落地、扎根、开花、结果，让企业充分享受审批制度改革带来的红利。